O SENAR é uma instituição vinculada à Confederação Nacional da Agricultura – CNA, em nível nacional, e às Federações de Agricultura, em nível estadual.
No estado de Santa Catarina, o SENAR está vinculado à FAESC, administrado por um Conselho formado por representantes da própria FAESC, OCESC, AGRO-INDÚSTRIAS, SENAR – ADMINISTRAÇÃO CENTRAL e FETAESC.
